Title image クロクサアリ Lasius fuji complex

アジア産アリ類DNA barcodeデータベース(AAntBOL)にようこそ!

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AAntBOLは、アジア産アリ類DNA barcodeデータベースです。DNAバーコードは特定の遺伝子領域の短い塩基配列を用いて生物種の同定を促進する手法で、動物では、ミトコンドリアゲノム上のCOI遺伝子の5′端約650塩基長が標準的なバーコード領域とされています。昆虫類ではチョウ目、ハエ目、ハナバチ類等で進められています。

AAntBOL はDNA バーコードデータとして、 LCO/HCOプライマーを用いた動物に一般的なCOIバーコード領域および他の領域を用いています。AAntBOLのデータ数は2015年2月16日現在 108件あります。これらのデータはいずれもbarcodeデータとともに、その証拠標本がGBIF(地球規模生物多様性情報機構)の標準書式 Darwin Core に従って作成され、学名、採集年月日、採集地、採集者等40項目を収録しています。今後順次データを蓄積し公開の予定です。


AAntBOLは、テキストデータベース管理システムSIGMAにより運用されています。

本データベースは日本学術振興会の科学研究費研究成果公開促進費(データベース)(代表者:多田内 修)の補助を受けています。

本データベースは、研究・教育用に無料で公開しています。




データの項目

データの項目とタグは下記の40項目です。

1.(DATE)Date Last Modified
2. (SID) DNA Sample ID
3. (AAntBOLID)AAntBOL ID
4. (GenBank) GenBank Accesssion No.
5. (BOLD) BOLD ID
6. (GEN) Genome
7. (LOCUS) Locus
8. (PCR) PCR Primers
9. (SEQ) Sequence
10. (IST) Institution Code
11. (COLC) Collection Code
12. (NAME) Scientific name
13. (JPNAME) Japanese name
14. (BR) Basis of Record
15. (KING) Kingdum
16. (PHY) Phylum
17. (CL) Class
18. (OR) Order
19. (FAM) Family
20. (GEN) Genus
21. (SP) Species
22. (SSP) Subspecies
23. (AU) Scientific Name Author
24. (IDENT) Identification By
25. (YIDENT) Year Identified
26. (TYPES) Type Status
27. (COL) Collector
28. (COLD) Collecting Date
29. (C) Country
30. (STATE) State Province
31. (COUNT) County
32. (LOC) Locality
33. (LON) Longitude
34. (LAT) Latitude
35. (SEX) Sex
36. (TYPE) Preparation Type
37. (RCAT) Related Catalog Item
38. (SDEP) Specimen Depository
39. (PUB) Publication
40. (NOTE) Notes


レコードの実例


Date Last Modified 2014 02 11
DNA Sample ID MM-LAS002
AAntBOL ID  
GenBank Accesssion No.  
BOLD ID  
Genome Mitochondrial
Locus COI (cytochrome c oxidase subunit I)
PCR Primers LCO1490/HCO2198
Sequence GATGTTGATATAAAATAGGGTCCCCACCACCTGATGGGTCAAAAAATGAAGTATTAAGGTTACGGTCGGTTAAGAGTATT GTAATAGCTCCTGCTAAAACAGGAAGAGATAAAAGTAATAAAATTGCGGTAATTAAAATTGATCAGACAAGTAAGGGAAT TTTGTCAATAGAAAAATTTTTATGATGTATATTTATAATAGTTGAAATGAAATTAATTGCCCCTAGAATGGAAGATATTC CAGCAATATGAAGAGAAAAAATAGTTAAATCAATTGAGGGGCCATTATGAAAAATGTTTGAAGCTAATGGTGGATAAACT GTTCATCCTGTCCCTACTCCGTCATTGATGAAATTTCTTAAGAGAAGAAGAGAGATTGAAGGTGGTAAAAGTCAGAATCT TATATTATTTATTCGAGGGTACGCTATATCAGGTGATCCTAATATTAAAGGTACAAGAAAATTTCCGAATCCCCCAATTA TAAAAGGTATAACTATAAAAAAAATTATAATGAATGCGTGTCTTGTAATTATAGAGTTATAAATTTGATCATTGTTAATA AGTGAATTTGATGAGCCCAGTTCTAATCGGATGATTATTCTTATAGAAGAACCAATCATACCGGCTCAAATAGCAAATAA AAAGTAAAGAATTCCAATATCTTTATGGATTTGTTGACCAC
Institution Code KUM
Collection Code  
Scientific name Lasius fuji complex
Japanese name クロクサアリ
Basis of Record S(標本); G(遺伝資源)
Kingdum Animalia
Phylum Arthropoda
Class Insecta
Order Hymenoptera
Family Formicidae
Genus Lasius
Species cf. fuji
Subspecies  
Scientific Name Author Radchenko, 2005
Identification By M. Maruyama
Year Identified 2009
Type Status  
Collector Maruyama-M
Collecting Date 2006/05/04
Country JP(JAPAN)
State Province Yamanashi
County Koshu-shi
Locality Enzan-kamihagiwara (450m), Koshu-shi, Yamanashi Pref., Honshu
Longitude  
Latitude  
Sex Female
Preparation Type  
Related Catalog Item  
Specimen Depository Kyushu University
Publication  
Notes  


参考資料

出版物・利用マニュアル・解説として、下記のものがあります。

   Tadauchi, O., C. Hirosawa, H. Inoue, T. Sugimoto, R. Murao, N. Takahashi, S. Sato, K. Mitai and Y. Hara, 2009. Specimen database AIIC, Asian insect information center database, based on types and normal specimens collected in Asia and the Pacific Area, Part 1. Esakia, (49): 1-5.



著作権

本データベースの著作権は、昆虫学データベース作成グループ(代表:多田内修、編集者:丸山宗利、藤原希美、板谷弘樹、システム管理: 井上仁、上塘深)に帰属します。本データベースの複製・転載・販売等の二次利用を堅くお断りします。



連絡先

利用法などのお問い合わせは下記宛に、メールでお願いいたします

812-8581 福岡市東区箱崎6-10-1
九州大学農学研究院昆虫学教室内
AAntBOL データベース係(担当: 多田内 修)
E-mail: tadauchi@kyudai.jp


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