Title image Andrena yamato Tadauchi et Hirashima の証拠標本

アジア産ハナバチ類DNA barcodeデータベース(ABeeBOL)にようこそ!

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ABeeBOLは、アジア産ハナバチ類DNA barcodeデータベースです。DNAバーコードは特定の遺伝子領域の短い塩基配列を用いて生物種の同定を促進する手法で、動物では、ミトコンドリアゲノム上のCOI遺伝子の5′端約650塩基長が標準的なバーコード領域とされています。昆虫類ではチョウ目、ハエ目などで進められていますが、ハナバチ類も、2008年にカナダ・ヨーク大学のLaurence Packer教授が中心となり、国際的なハナバチ類のDNAバーコード推進委員会 (BeeBOL) が発足しデータが急速に増えています。

ABeeBOL はDNA バーコードデータとして、一般的なCOIバーコード領域および他の領域を用いています。ABeeBOLのデータ数は2015年1月9日現在 252件あります。これらのデータはいずれもbarcodeデータとともに、その証拠標本がGBIF(地球規模生物多様性情報機構)の標準書式 Darwin Core に従って作成され、学名、採集年月日、採集地、採集者等40項目を収録しています。今後順次データを蓄積し公開の予定です。


ABeeBOLは、テキストデータベース管理システムSIGMAにより運用されています。

本データベースは日本学術振興会の科学研究費研究成果公開促進費(データベース)(代表者:多田内修)および環境省環境総合推進費(S-9-2-(8))(代表者:多田内修)の補助を受けています。

本データベースは、研究・教育用に無料で公開しています。




データの項目

データの項目とタグは下記の41項目です。

1.(DATE)Date Last Modified
2. (SID) DNA Sample ID
3. (ABeeBOLID)ABeeBOL ID
4. (GenBank) GenBank Accesssion No.
5. (BOLD) BOLD ID
6. (GEN) Genome
7. (LOCUS) Locus
8. (PCR) PCR Primers
9. (SEQ) Sequence
10. (IST) Institution Code
11. (COLC) Collection Code
12. (NAME) Scientific name
13. (JPNAME) Japanese name
14. (BR) Basis of Record
15. (KING) Kingdum
16. (PHY) Phylum
17. (CL) Class
18. (OR) Order
19. (FAM) Family
20. (GEN) Genus
21. (SP) Species
22. (SSP) Subspecies
23. (AU) Scientific Name Author
24. (IDENT) Identification By
25. (YIDENT) Year Identified
26. (TYPES) Type Status
27. (COL) Collector
28. (COLD) Collecting Date
29. (C) Country
30. (STATE) State Province
31. (COUNT) County
32. (LOC) Locality
33. (LON) Longitude
34. (LAT) Latitude
35. (SEX) Sex
36. (TYPE) Preparation Type
37. (RCAT) Related Catalog Item
38. (SDEP) Specimen Depository
39. (PUB) Publication
40. (NOTE) Notes
41. (IMAGE) Image


レコードの実例


Date Last Modified 2013 12. 17
DNA Sample ID DNA000130
ABeeBOL ID ABeeBOL No.27
GenBank Accesssion No.  
BOLD ID  
Genome Mitochondrial
Locus COI (cytochrome c oxidase subunit I)
PCR Primers COI_pF2/COI_2437d
Sequence ATGATTAGTTCCACTAATAATTGGAGCCCCTGATATAGCATTCCCACGAATAAATAATATAAGATTCTGACTCCTT-ATT CCTTCCCTATTTATATTATTAATAAGAAGAATTCTAGCCTCTGGATCAGGAACAGGATGAACAGTATACCCCCCACTTTC TTCAATTATATACCATTCATCAATCTCAGTAGATTGCACAATTTTTTCATTACATATCGCAGGAATTTCATCAATTATAG GAGCTATTAATTTTATTGTTTCAATTATATTAATAAAAAATATTTCAATTAATTATGATCAAATTCCACTATTTCCATGA TCAGTAAAAATTACTGCTATTCTATTACTATTATCTTTACCAGTACTAGCAGGAGCTATTACAATACTATTAACTGATCG AAATTTAAATACCTCATTTTTCGACCCCTCAGGAGGAGGAGACCCTATTCTTTATCAACATCTATTTTGATTCTTTGGTC ACCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGGATTTGGATTAATTTCACATATCATTTTTAATGAAAGAGGTAAAAAGGAA ATCTTTGGTAATTTAGGTATAATTTATGCTATACTAGGAATTGGATTTTTAGGATTCATTGTTTGAGCCCATCACATATT CACAGTAGGTCTAGACGTTGATACACGAGCATATTTTACATCTGCAACAATAATTATTGCAGTACCTA
Institution Code ELKU
Collection Code ABeeBOL
Scientific name Lasioglossum (Evylaeus) metis
Japanese name ツヤチビコハナバチ
Basis of Record S(標本); G(遺伝資源)
Kingdum Animalia
Phylum Arthropoda
Class Insecta
Order Hymenoptera
Family Halictidae
Genus Lasioglossum
Species metis
Subspecies  
Scientific Name Author Ebmer, 2002
Identification By Ryuki Murao
Year Identified 2013
Type Status  
Collector Ryuki Murao
Collecting Date 13/06/2013
Country JP(JAPAN)
State Province Fukuoka
County Tagawa-gun
Locality Kyushu Univ., Hikosan Exp. Sta., Soeda-machi
Longitude 130.9154033
Latitude 33.48020722
Sex F
Preparation Type Normal
Related Catalog Item  
Specimen Depository Kyushu University
Publication  
Notes  
Image TDNA000130 sample


参考資料

出版物・利用マニュアル・解説として、下記のものがあります。

   Tadauchi, O., C. Hirosawa, H. Inoue, T. Sugimoto, R. Murao, N. Takahashi, S. Sato, K. Mitai and Y. Hara, 2009. Specimen database AIIC, Asian insect information center database, based on types and normal specimens collected in Asia and the Pacific Area, Part 1. Esakia, (49): 1-5.



著作権

本データベースの著作権は、昆虫学データベース作成グループ(代表:多田内修、編集者:多田内修、村尾竜起、丸山宗利、システム管理: 井上仁、上塘深)に帰属します。本データベースの複製・転載・販売等の二次利用を堅くお断りします。

本サービスを用いて研究を発表する場合に推奨される引用形式:
村尾竜起・多田内修 (2013-)「昆虫学データベース ABeeBOL,http://konchudb.agr.agr.kyushu-u.ac.jp/abeebol/index-j.html(2013年12月19日)」



連絡先

利用法などのお問い合わせは下記宛に、メールでお願いいたします

812-8581 福岡市東区箱崎6-10-1
九州大学農学研究院昆虫学教室内
ABeeBOL データベース係(担当: 多田内 修)
E-mail: tadauchi@kyudai.jp


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